分子模拟技术在酶工程与酶设计的应用
——同源建模、分子对接、分子动力学、QM/MM、虚拟氨基酸突变等
尊敬的老师和同学,您好!
创腾科技有限公司将于2015年4月22日至24日举办一期针对酶的理性设计的生命科学分子模拟培训班。本次课程的培训主题是 “分子模拟技术在酶工程与酶设计的应用——同源建模、分子对接、分子动力学、QM/MM、虚拟氨基酸突变等”,共为期三天。
如果您从事酶相关研究领域的研究工作,对分子模拟和Discovery Studio感兴趣,想要借助DS中的模拟技术来开展酶的理性设计相关工作,包括从分子水平分析和预测酶结构,从分子水平预测并解释酶-底物的作用机制,借助计算模拟技术改造并优化酶、建议可能的突变位点以提高酶的稳定性、同底物的亲和力等工作,那么您可以参加此次的培训课程。通过本次培训课程,您可以快速掌握各模拟技术的核心原理并快速上机操作,将各模拟方法灵活应用到实际的酶领域相关研究课题中,解决实际的应用问题。
培训相关信息如下:
课程时间:4月22-24日,共三天
课程地点:创腾科技培训中心(上海浦东新区芳甸路1088号紫竹国际大厦2104室)
课程名称:酶催化机理及酶设计
一、培训内容 |
本次培训以Discovery Studio4.1软件的基础操作和应用为核心,以酶催化机理及理性设计为基础,针对酶催化机理及设计中所涉及的技术进行介绍与上机操作,包括:基于酶的一级序列预测翻译后修饰位点和酶的三维结构、酶-底物相互作用预测及优化、通过虚拟氨基酸突变设计同底物亲和力更高的酶或稳定性更高的酶、预测并引入新的二硫键提高酶的稳定性、预测酶结构表面易聚集的位点并进行突变优化等等。
二、培训形式 |
1、通过文献案例分析讲解酶理性设计策略,以及相应功能模块的原理介绍;
2、上机操作:讲解酶理性设计过程中每一步骤的具体操作流程及参数设置(提供完整的培训教程);
3、学员交流与讨论,工程师进行现场答疑答疑。
三、培训对象 |
没有或只有少量模拟研究经验,或刚开始使用Discovery Studio软件、希望进一步系统掌握软件使用技巧、能够快速上机模拟操作相关课题的酶研究领域人员。
四、资格认证考试 |
本培训课程提供收费的资格认证考试。详情内容可参考附件2《北京创腾科技有限公司联合培养计划》。
五、课程费用 |
培训费用 | 1人参加 | 优惠条件1: 4月15日前成功报名并汇款 | 优惠条件2: 同一单位,多人参加同一门课程; 或同一学员(2011年至今)多次参加创腾科技培训课程 | |
2人或2次以上 | 3人或3次以上 | |||
学术客户 | 3600/人 | 3000/人 | 3000/人 | 2700/人 |
企业客户 | 5400/人 | 4800/人 | 4800/人 | 4500/人 |
注: 1、需要认证的学员需另付考试认证费,人民币800元。
2、培训费包含听课费、资料费、上机费、午餐。住宿和交通费自理。
3、统一开据发票内容为 “培训费”,发票将在培训期间发给学员,若您对发票内容有特殊要求请务必在回执中注明。
六、报名方式 |
报名方式:登录创腾学院官网http://training.neotrident.com/ 在线提交或下载报名回执。名额有限,报名从速,额满为止。
付费方式:
a、银行汇款(请在汇款时务必备注参加人员姓名)
户 名:北京创腾科技有限公司上海分公司
开户行:中国工商银行上海市分行浦东开发区白杨路支行
账 户:1001154119006907319
b、现金支付:培训现场可收取现金或刷卡。
七、周边住宿(供参考,请自行预定) |
宾馆名称:锦江之星(上海磁悬浮总店)021-51099066
宾馆地址:上海浦东新区白杨路260号(浦东新国际博览中心 近龙阳路)
宾馆名称:锦江之星(新国际博览中心店)021-68920708
宾馆地址:上海浦东新区芳华路37号(浦东新国际博览中心 近沪南路)
宾馆名称:汉庭酒店(上海龙阳路店) 021-61657988
宾馆地址:上海市浦东新区龙阳路2000号(近白杨路,磁悬浮总站)
注:以上三个经济型酒店供学员参考。因培训地址离国际博览中心较近,遇到展览旺季,周边住宿非常紧张,提醒学员提早预定住宿。
八、交通地图 |
交通:乘地铁7号线花木路站下,4号出口,出站即到。
地理位置 紫竹大厦
九、培训班联系人 |
创腾科技有限公司 市场部
电话:021-58353866-219(崔小姐),13916476330
021-58353866-233(陈小姐),13916858963
Email:market@neotrident.com
培训网站:http://training.neotrident.com/
创腾科技有限公司 生命科学部
2015年3月3日
附件一:培训班课程日程安排
附件一:北京创腾科技有限公司联合培养计划
附件一:培训班课程日程安排
日期 | 时间 | 内容 |
4月22日
| 08:30-09:00 | 报到和注册 |
09:00-10:15 | Discovery Studio基本界面 DS背景介绍,DS界面介绍,蛋白与小分子的预处理方法介绍与实际操作。 | |
10:15-10:30 | 茶歇 | |
10:30-11:45 | 酶催化机理及酶设计概述 酶催化机理及酶设计专题之一:酶的序列分析 基于酶的一级序列预测其翻译后修饰位点,应用与操作。 酶催化机理及酶设计专题之二:酶结构的构建 同源建模核心原理介绍及案例分析,同源模板的选取技巧、同源模型的优化与评价等。 | |
11:45-13:30 | 午餐 | |
13:30-15:00 | 酶催化机理及酶设计专题之二:酶结构的构建 同源建模参数设置意义、实际操作技巧及结果分析。 | |
15:00-15:15 | 茶歇 | |
15:15-16:30 | 酶催化机理及酶设计专题之三:酶与底物相互作用机理研究(CDocker) 分子对接的核心与原理,酶催化位点的定义,酶-底物最终作用模式的选取与分析,关键氨基酸位点的识别与显示方法,CDOCKER基本原理及案例分析。 | |
16:30-17:15 | 课程讨论及答疑 | |
4月23日
| 09:00-10:30 | 酶催化机理及酶设计专题之三:酶与底物相互作用机理研究(CDocker) CDOCKER参数设置意义、实际操作技巧及结果分析。 |
10:30-10:45 | 茶歇 | |
10:45-11:45 | 酶催化机理及酶设计专题之三:酶与底物相互作用机理研究(FlexDock) 对接过程中蛋白分子柔性的考虑方法,Flexible Docking基本原理介绍、案例分析。 | |
11:45-13:30 | 午餐 | |
13:30-14:45 | 酶催化机理及酶设计专题之三:酶与底物相互作用机理研究(FlexDock)参数设置意义、Flexible Docking实际操作技巧及结果分析 | |
14:45-15:00 | 茶歇 | |
15:00-15:45 | 酶催化机理及酶设计专题之三:酶与底物相互作用机理研究(分子动力学模拟) MD基本原理,溶剂模型的添加,束缚条件的设定,平衡状态的判定等。 | |
15:45-16:45 | 酶催化机理及酶设计专题之三:酶与底物相互作用机理研究(分子动力学模拟) MD参数设置意义、实际操作技巧及结果分析。 | |
16:45-17:15 | 课程讨论及答疑 | |
4月24号 | 09:00-10:00 | 酶催化机理及酶设计专题之三:酶与底物相互作用机理研究 |