时间地点:
培训时间:第一期2015年3月16日-20日(报名中)
培训地点:北京海淀区丰贤中路7号
主办单位:
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
课程内容:
实验操作 上午:9:00-11:30 下午:12:30-17:00 上机操作 上午:9:00-11:30 下午:13:00-17:00
日期 | 授课题目 | 授课内容 | 课程类型 | 费用 |
第一天 | 转录组测序及其应用简介 |
1、 开班仪式 2、转录组技术流程及技术细节 | 实验操作 | 3500元/人 |
转录组建库流程-1 |
1、总RNA样品质检(观摩) 2、mRNA分离纯化 3、 mRNA片段化 4、 逆转录-一链合成 5、 逆转录-二链合成 6、 磁珠纯化逆转录产物 | |||
第二天 | 转录组建库流程-2 |
1、 产物末端修复并加A 2、 连接接头 3、 磁珠纯化连接产物 4、 PCR富集文库 | ||
实验交流-实验间歇进行 |
1、讲解各步骤实验原理 2、实验细节技术交流 3、参观北京市理化分析测试中心永丰分部实验室 | |||
第三天 | 转录组建库流程-3 |
1、 凝胶纯化文库 2、 文库质检 | ||
讲座 |
报告题目:基因组学研究进展及应用 报告人:中国科学院北京基因组研究所 于军研究员 | |||
转录组数据分析实例(上机操作) |
1、linux基础 掌握Linux系统下的常用命令(重点) 掌握linux环境下软件的安装使用 了解shell脚本的编写 2、转录组数据准备和软件介绍 3、转录组数据的比对(重点讲解) 4、表达量估计和分析(重点讲解) | 上机操作 | 3500元/人 | |
第四天 | 转录组组拼接及功能注释 |
1、转录组序列拼接的技术方法 2、常用软件及转录组个性化组装的技巧 3、使用R语言相关的软件包对转录组学的高通量测序数据进行分析。讲解差异表达分析,GO分析,Pathway分析,聚类分析等。 4、讲解如何绘制表达量的热图等 | ||
转录组拼接组装(上机操作) |
1、转录组组装的流程介绍 2、原始测序数据的预处理 3、介绍Trinity的使用,并以测试测序数据为例进行组装 4、介绍cdhit的是使用,并以测试组装结果为例进行聚类 5、介绍寻找ORF的方法 | |||
第五天 | microRNA测序与数据分析 |
1、microRNA目前的应用、发展历史以及microRNA的定义 2、microRNA的生物学过程(重点讲解) 3、microRNA的测序(重点讲解) 4、microRNA测序数据分析软件(重点讲解) 5、microRNA目前的挑战以及将来的研究前景 6、microRNA测序数据分析案例展示(重点讲解) 7、近期文献 | ||
microRNA数据分析实例(上机操作) |
1、 microRNA测序数据预处理(重点讲解) 2、 测序数据长度分布计算 3、 microRNA的预测(重点讲解) 4、 microRNA碱基偏好性计算 |
【注】:(课程内容以实际授课为准)
注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。
报名费用:
1、实验操作 3500元/人(含教材费、午餐费、欢迎晚宴、实验耗材费)。
2、上机操作3500元/人(含听课费、资料费、上机费),请自带笔记本电脑以备上机实践使用)。
3、实验操作+上机操作全选,6500元/人。
4、主办方可协助安排入住酒店,住宿费用自理。
报名优惠政策:
1、同一单位两人以上参会优惠200元/人。
2、上机操作3人以上团体报名每人可减少400元;
3、上机操作4+1团报,可免费赠送一个名额
4、上面4种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。
注意事项:
1、 已经成功付款的学员,如在开课前7个工作日前联系主办方撤销席位,可退还100%的注册费用;如在开课前3个工作日内(含3个工作日)要求撤销席位则退还80%的注册费用。
2、 撤销席位后,学员可提交延期申请,可参加当前时间到2015.12.12日期间由北京市计算中心举办的各类培训,费用将采取多退少补原则。逾期不参加任何培训课程可申请退款,退款期间产生的所有费用由学员本人承担。
付费方式:
现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称:北京市计算中心
账 号:0200151819100023937
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(请在汇款明细中注明“生物计算事业部——学员姓名”)
联系方式:
联系人:李志艳
Tel:15801563149
QQ:2767238057