近年来,随着高通量测序技术的迅猛发展,转录组研究从以前的微阵列技术,SAGE及MPSS技术的低通量模式切换至RNA-seq的高通量模式。转录组学作为一个伴随高通量测序技术率先发展起来的技术开始在生物学前沿研究中得到了广泛的应用。RNA-seq对于真核生物的基因表达调控,癌症等疾病的发生机制和新治疗方案确定,遗传育种等众多方面的研究具有不可估量的潜力。为了辅助广大科研工作者掌握转录组高通量测序技术原理、实验设计以及后期数据分析技能,北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心举办“转录组学”培训研习班。


时间地点:

培训时间:第一期2015年3月16日-20日(报名中)
培训地点:北京海淀区丰贤中路7号

主办单位:

北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心

课程内容:

实验操作 上午:9:00-11:30 下午:12:30-17:00 上机操作 上午:9:00-11:30 下午:13:00-17:00

日期 授课题目 授课内容 课程类型 费用
第一天 转录组测序及其应用简介 1、 开班仪式
2、转录组技术流程及技术细节
实验操作 3500元/人
转录组建库流程-1 1、总RNA样品质检(观摩)
2、mRNA分离纯化
3、 mRNA片段化
4、 逆转录-一链合成
5、 逆转录-二链合成
6、 磁珠纯化逆转录产物
第二天 转录组建库流程-2 1、 产物末端修复并加A
2、 连接接头
3、 磁珠纯化连接产物
4、 PCR富集文库
实验交流-实验间歇进行 1、讲解各步骤实验原理
2、实验细节技术交流
3、参观北京市理化分析测试中心永丰分部实验室
第三天 转录组建库流程-3 1、 凝胶纯化文库
2、 文库质检
讲座 报告题目:基因组学研究进展及应用
报告人:中国科学院北京基因组研究所 于军研究员
转录组数据分析实例(上机操作) 1、linux基础
掌握Linux系统下的常用命令(重点)
掌握linux环境下软件的安装使用
了解shell脚本的编写
2、转录组数据准备和软件介绍
3、转录组数据的比对(重点讲解)
4、表达量估计和分析(重点讲解)
上机操作 3500元/人
第四天 转录组组拼接及功能注释 1、转录组序列拼接的技术方法
2、常用软件及转录组个性化组装的技巧
3、使用R语言相关的软件包对转录组学的高通量测序数据进行分析。讲解差异表达分析,GO分析,Pathway分析,聚类分析等。
4、讲解如何绘制表达量的热图等

转录组拼接组装(上机操作) 1、转录组组装的流程介绍
2、原始测序数据的预处理
3、介绍Trinity的使用,并以测试测序数据为例进行组装
4、介绍cdhit的是使用,并以测试组装结果为例进行聚类
5、介绍寻找ORF的方法
第五天 microRNA测序与数据分析 1、microRNA目前的应用、发展历史以及microRNA的定义
2、microRNA的生物学过程(重点讲解)
3、microRNA的测序(重点讲解)
4、microRNA测序数据分析软件(重点讲解)
5、microRNA目前的挑战以及将来的研究前景
6、microRNA测序数据分析案例展示(重点讲解)
7、近期文献
microRNA数据分析实例(上机操作) 1、 microRNA测序数据预处理(重点讲解)
2、 测序数据长度分布计算
3、 microRNA的预测(重点讲解)
4、 microRNA碱基偏好性计算


【注】:(课程内容以实际授课为准)

注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。

报名费用:

1、实验操作 3500元/人(含教材费、午餐费、欢迎晚宴、实验耗材费)。
2、上机操作3500元/人(含听课费、资料费、上机费),请自带笔记本电脑以备上机实践使用)。
3、实验操作+上机操作全选,6500元/人。
4、主办方可协助安排入住酒店,住宿费用自理。

报名优惠政策:

1、同一单位两人以上参会优惠200元/人。
2、上机操作3人以上团体报名每人可减少400元;
3、上机操作4+1团报,可免费赠送一个名额
4、上面4种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。

注意事项:

1、 已经成功付款的学员,如在开课前7个工作日前联系主办方撤销席位,可退还100%的注册费用;如在开课前3个工作日内(含3个工作日)要求撤销席位则退还80%的注册费用。

2、 撤销席位后,学员可提交延期申请,可参加当前时间到2015.12.12日期间由北京市计算中心举办的各类培训,费用将采取多退少补原则。逾期不参加任何培训课程可申请退款,退款期间产生的所有费用由学员本人承担。

付费方式:

现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称:北京市计算中心
账 号:0200151819100023937
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(请在汇款明细中注明“生物计算事业部——学员姓名”)

联系方式:

联系人:李志艳

Tel:15801563149

QQ:2767238057