通过全基因组重测序的序列比对,研究者可以找到大量的单核苷酸多态性位点(SNP)、拷贝数变异(CNV)、插入缺失(InDel)、结构变异(SV)等变异位点。并通过对已知全基因组序列的物种进行测序,来研究个体或群体间的相关变异信息,从而找出与疾病、性状、以及功能有关的基因,进行个体或群体分子水平的差异分析。随着测序成本的大幅度降低以及测序效率的数量级提升,再加上已知基因组序列的物种增多,全基因组重测序已成为动植物物种遗传差异研究、功能基因挖掘等最可靠的方法。为了更好的服务于广大科研工作者的需要,北京市计算中心生物计算事业部举办“重测序”专题研讨班。每期名额有限,欢迎您参加!


时间地点:

时间:2015年3月15-17日
地点:北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼

主办单位:

北京市计算中心

课程内容:上午:9:30-11:30下午:13:30-17:00
日期 授课题目 授课内容
第一天 重测序研究背景及理论 Ø  生物信息学知识背景概述;
Ø  二代测序的基本概况和技术发展简介;
Ø  重测序的基本概念、研究历史、内容和意义;
Ø  重测序研究策略以及技术、前沿热点及趋势;
Linux上机操作及生物信息学软件安装 Ø  linux基础基本操作;
Ø  生物信息学软件应用及常用软件介绍、重测序相关分析软件介绍及安装;
第二天 动物、植物、微生物重测序的案例分析应用及分析流程(个体水平) Ø  动物重测序理论与案例分析;
Ø  植物重测序理论与案例分析;
Ø  微生物重测序理论与案例分析;
重测序分析上机练习(以细菌和植物为例) Ø  重测序的分析流程;
Ø  原始测序数据的质控及过滤;
Ø  学习bwa,samtools,pindel等工具的使用,进行calling SNP、INDEL、SV,变异注释及功能分析;
第三天 重测序(外显子组测序)在群体遗传学中的应用(群体水平) Ø  群体遗传学理论:
Ø  进化分析;
Ø  GWAS分析;
群体水平测序数据分析实例 (上机操作) Ø  混池重测序的进化分析流程;
Ø  孟德尔疾病的外显子组测序分析流程;
Ø  低覆盖度重测序与缺失基因型填充(Imputation)分析流程;
Ø  复杂疾病的重测序GWAS分析流程。

【注】:(课程内容以实际授课为准)

注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。

报名费用:

注册费:工作人员3000元/人、学生2500元/人(含听课费、资料费、上机费、午餐,请自带笔记本电脑以备上机实践使用),主办方可协助安排入住酒店,住宿费用自理。

报名优惠政策:

1、2.10日前预报名的学员每人可优惠200元。
2、2人团报每人可减免200元,3人以上团体报名每人可减少400元;
3、4+1团报,可免费赠送一个名额
4、上面4种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。
5、老学员、老学员介绍的学员均可以再优惠200元。
注:
培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。

注意事项:

1、 已经成功付款的学员,如在开课前7个工作日前联系主办方撤销席位,可退还100%的注册费用;如在开课前3个工作日内(含3个工作日)要求撤销席位则退还80%的注册费用。

2、 撤销席位后,学员可提交延期申请,可参加当前时间到2015.12.12日期间由北京市计算中心举办的各类培训,费用将采取多退少补原则。逾期不参加任何培训课程可申请退款,退款期间产生的所有费用由学员本人承担。

付费方式:

现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称:北京市计算中心
账 号:0200151819100023937
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(请在汇款明细中注明“生物计算事业部——学员姓名”)

联系方式:
张利英 电话:010-59341771 手机:18618295767 邮箱:zhangly@bcc.ac.cn QQ:2814500767
员丽丽 电话:010-59341773 手机:18701529461 邮箱:yuanll@bcc.ac.cn